Nevada

[Desert rabbit]

Саша. Reno, Nevada, USA.

30 лет назад - СПБ. Учился на одном потоке с Ивановым и Путиным (на соседних факультетах). Я - был тогда геолог, они - гуманитары... :)

Теперь они - нефтянники, а я - мат. генетик/иммунолог. :)

 

С помощью Форекс надеюсь создать новую модель финансирования стартап-ов. За 20 лет надоели полуграмотные инвесторы, самовлюбленные "эксперты" и сонные бюрократы.

[Nestor]

Как интересно! В далеком прошлом иммунолог. Сейчас потихоньку становлюсь финансистом.

[Desert rabbit]

  Nestor сказал:

Как интересно! В далеком прошлом иммунолог. Сейчас потихоньку становлюсь финансистом.

 

Ну тогда Вам будет интересно узнать что нам удалось создать целое семейство математически "генно-вычисленных" синтетических коротко-пептидных вакцин (22-28 аминокислот) против целой группы вирусов как животных так и человека успешно испытанных на животных. И имеем наглость думать что можем сей процесс повторить на друхих вирусах! Именно на продолжение этой работы (в частности на испытания на людях)и пойдут финансовые средства которые мы попытаемся сами и с помощью друзей и союзников вырвать из лап форекса.

[Nestor]

  Desert rabbit сказал:

 

Ну тогда Вам будет интересно узнать что нам удалось создать целое семейство математически "генно-вычисленных" синтетических коротко-пептидных вакцин (22-28 аминокислот) против целой группы вирусов как животных так и человека успешно испытанных на животных. И имеем наглость думать что можем сей процесс повторить на друхих вирусах! Именно на продолжение этой работы (в частности на испытания на людях)и пойдут финансовые средства которые мы попытаемся сами и с помощью друзей и союзников вырвать из лап форекса.

Круто. То есть анализируя геном вируса, Вы смогли найти комбинацию, служащую вакциной. Или в анализ бралась пептидная оболочка вируса?

[Desert rabbit]

  Nestor сказал:

Круто. То есть анализируя геном вируса, Вы смогли найти комбинацию, служащую вакциной. Или в анализ бралась пептидная оболочка вируса?

 

Бот так Вам всЁ и расскажи :)

Да, брался весь геном, целиком и получившиеся пептиды (их несколько и ВСЕ работают) - сии пептиды не оболочечные. По неясному пока механизму (MHC?) иммунная система видит это пептид как вирусный эпитоп (хотя забегая вперед скажу что в нормальном смысле это НЕ эпитоп) и генерирует (я могу делать ошибки в русской терминологии так как всю генетику и иммунологию учил уже здесь, по-аглицки) антитела, которые волшебным образом нейтрализуют всю группу вирусов (даже вирусов животных), хотя математика была сделана лишь на одном из вирусных геномов!

[Nestor]

  Desert rabbit сказал:

 

Бот так Вам всЁ и расскажи :)

Да, брался весь геном, целиком и получившиеся пептиды (их несколько и ВСЕ работают) - сии пептиды не оболочечные. По неясному пока механизму (MHC?) иммунная система видит это пептид как вирусный эпитоп (хотя забегая вперед скажу что в нормальном смысле это НЕ эпитоп) и генерирует (я могу делать ошибки в русской терминологии так как всю генетику и иммунологию учил уже здесь, по-аглицки) антитела, которые волшебным образом нейтрализуют всю группу вирусов (даже вирусов животных), хотя математика была сделана лишь на одном из вирусных геномов!

Вот это да! Получается, что в анализ брались не оболочечные пептиды (т.к. вирус может приспосабливаться и защищаться, меняя их), а анализировался геном, что дало возможность напрямую предсказать структуру пептида на который должна реагировать иммунная система, не отвлекаясь на вирусную маскировку. Здорово! Ударили прямо в уязвимое место! Молодцы!

Но, я думаю, все равно данная пептидная комбинация должна прятаться где-то в оболочке вируса, чтоб иммунная с-ма могла его идентифицировать.

Хотя, как продукт деятельности вирусного генома, наверняка оставляет свои маркеры на мембране пораженной клетки.

Если нет, то возможен еще неоткрытый механизм обнаружения вируса. Можно будет копать в этом направлении.

[Desert rabbit]

  Nestor сказал:

Вот это да! Получается, что в анализ брались не оболочечные пептиды (т.к. вирус может приспосабливаться и защищаться, меняя их), а анализировался геном, что дало возможность напрямую предсказать структуру пептида на который должна реагировать иммунная система, не отвлекаясь на вирусную маскировку. Здорово! Ударили прямо в уязвимое место! Молодцы!

Но, я думаю, все равно данная пептидная комбинация должна прятаться где-то в оболочке вируса, чтоб иммунная с-ма могла его идентифицировать.

Хотя, как продукт деятельности вирусного генома, наверняка оставляет свои маркеры на мембране пораженной клетки.

Если нет, то возможен еще неоткрытый механизм обнаружения вируса. Можно будет копать в этом направлении.

 

Моя интуиция говорит мне что сама идея что есть эпитоп может коренным образом изменится. Понимая эпитоп как некий сигнал вызывающее внимание иммунной системы с неким последующим синтезом того что мы сегодня называем антителом (т.е. неким афинным к эпитопу комплексом)в принципе мы можем начать рассматривать имунную систему как протеиновую фабрику способную происводить весьма широкий набор пептидов совсем не обязательно лишь анти-вирусного действия, а практически для широкого спектра целей. Такая внутренняя протеиновая мануфактура программно запускающаяся серией специально для этого вычисленных и синтезировааных сигналов.

Например - блокировочных протеинов против выпускаемых по ошибке этй же фабрикой ауто-имунных антител :)

Ну и ваще, в натуре, блин...

[Nestor]

  Desert rabbit сказал:

 

Моя интуиция говорит мне что сама идея что есть эпитоп может коренным образом изменится. Понимая эпитоп как некий сигнал вызывающее внимание иммунной системы с неким последующим синтезом того что мы сегодня называем антителом (т.е. неким афинным к эпитопу комплексом)в принципе мы можем начать рассматривать имунную систему как протеиновую фабрику способную происводить весьма широкий набор пептидов совсем не обязательно лишь анти-вирусного действия, а практически для широкого спектра целей. Такая внутренняя протеиновая мануфактура программно запускающаяся серией специально для этого вычисленных и синтезировааных сигналов.

Например - блокировочных протеинов против выпускаемых по ошибке этй же фабрикой ауто-имунных антител :)

Сигнал то есть. Вот только вирусы научились хорошо маскироваться. А тут получается прямая подсказка организму на что в 1-ю очередь стоит обратить внимание, чтоб не работать в холостую. Интересно было бы проверить идею лечения генетических заболеваний. Вызывается ошибкой в гене. Вот против него и напрвить селективное оружие. Проблема в том, что тут уже более сложный белок синтезируется. Т.е. можно, наверное, вычислить против каких именно аминокислотных комбинаций стоит выработать оружие для блокировки ошибочного гена (как Вы сделали по отношению к вирусам).

Я уж молчу про онко заболевания. Перспективы...!!!

 

  Цитата

Ну и ваще, в натуре, блин...

[Desert rabbit]

  Nestor сказал:

Сигнал то есть. Вот только вирусы научились хорошо маскироваться. А тут получается прямая подсказка организму на что в 1-ю очередь стоит обратить внимание, чтоб не работать в холостую. Интересно было бы проверить идею лечения генетических заболеваний. Вызывается ошибкой в гене. Вот против него и напрвить селективное оружие. Проблема в том, что тут уже более сложный белок синтезируется. Т.е. можно, наверное, вычислить против каких именно аминокислотных комбинаций стоит выработать оружие для блокировки ошибочного гена (как Вы сделали по отношению к вирусам).

Я уж молчу про онко заболевания. Перспективы...!!!

 

Те структуры к которым афинны наши пептиды - глубоко внутри. Предположить легкую возможность маскировки против таких пептидов это как если бы танк маскировался окрашиванием щестеренок в коробке передач в зеленый цвет. Нет, генной инженерией в данном случае заниматься рано. проещ дело обстоит - вакцины к целым группам вирусов и к быстромутирющим. Готовлю вот статью предлагающую универсальную гриппозную вакцину против всех гриппов вообще, независомо от набора гемаглюттининов и нейроминидаз. Хоть с несуществующими типами.

Еще кайф в том что при наличии быстых компьютеров процесс от момента когда секвинирован только что появившийся новый вирус до формулы первых вариантов вакцины которую тут же можно синтезировать и испытывать, занимает несколько десятков часов. Сравинте с традиционным. Ну и вариантов вакцины как правило сразу несколько. И работающую вакцину можно синтезировать тоннами в час за копейки. И без вирусных лабораторой и всей этой жуткой мутоты с репликацией вирусов.

Представляете?

Если бы еще можно было испытывать на людях в режиме мат моделирования... Но это уже "мечты геолога о теплой Марусе в холодной палатке" :)

[Nestor]

  Desert rabbit сказал:

 

Те структуры к которым афинны наши пептиды - глубоко внутри. Предположить легкую возможность маскировки против таких пептидов это как если бы танк маскировался окрашиванием щестеренок в коробке передач в зеленый цвет. Нет, генной инженерией в данном случае заниматься рано. проещ дело обстоит - вакцины к целым группам вирусов и к быстромутирющим. Готовлю вот статью предлагающую универсальную гриппозную вакцину против всех гриппов вообще, независомо от набора гемаглюттининов и нейроминидаз. Хоть с несуществующими типами.

Так я это и имел ввиду под маскировкой, когда чувствительный внутренний пептид остается внутри, а вместо него вирус бросает на мембрану клетки отвлекающие ловушки для АТ.

То что Вы сделали - это переворот. Не дадите ссылок на журналы с Вашими статьями?

 

  Цитата

Еще кайф в том что при наличии быстых компьютеров процесс от момента когда секвинирован только что появившийся новый вирус до формулы первых вариантов вакцины которую тут же можно синтезировать и испытывать, занимает несколько десятков часов. Сравинте с традиционным. Ну и вариантов вакцины как правило сразу несколько. И работающую вакцину можно синтезировать тоннами в час за копейки. И без вирусных лабораторой и всей этой жуткой мутоты с репликацией вирусов.

Представляете?

Если бы еще можно было испытывать на людях в режиме мат моделирования... Но это уже "мечты геолога о теплой Марусе в холодной палатке" :)

Это вообще фантастика. Кто бы мог подумать о таком еще лет 10 назад.

  Цитата

Если бы еще можно было испытывать на людях в режиме мат моделирования

Почему бы нет? Потом, возможно, сократит фазу клин испытаний.

[Desert rabbit]

  Nestor сказал:

Так я это и имел ввиду под маскировкой, когда чувствительный внутренний пептид остается внутри, а вместо него вирус бросает на мембрану клетки отвлекающие ловушки для АТ.

То что Вы сделали - это переворот. Не дадите ссылок на журналы с Вашими статьями?

Это вообще фантастика. Кто бы мог подумать о таком еще лет 10 назад.

 

Почему бы нет? Потом, возможно, сократит фазу клин испытаний.

 

 

Хо-хо, клин испытания сократит... Главное - бабло сократит нужное на испытания! Появится возможность нормальным людя и странам свои препараты испытывать!

Бабла знаете сколько это стоит? Сегодня что бы пройти FDA препарату надо потратить как минимум 20-30 миллионов долл. А в среднем 60. Поэтому-то это и клуб избранных. Кто кроме десятка крупных фарма концернов может себе такое позволить? А почему до сих пор нет радикальных средств от рака Вы не задумывались? Потому что миллиарды делаются на препаратах операциях и сервисах ОБСЛУЖИВАЮЩИХ рак.

 

Ну что Вы, какие статьи. Мы же не академики, а крошечная группа исследователей. Все на свои деньги. Мы не можем себе позволить результаты раздавать :) Будем чихать в пыли.

Поищите мои американские патенты по Гуглу на ключевые слова "Chaihorsky patent herpes".

Вот щас с помощью В.В и Жени прорвусь к пониманию врашения векторов трендов и начнем бросок. А то всё на инвесторов рассчитывали да на помавающих руками. Но с нынешним идиотом-марионеткой в Белом Доме они все поглупели безвозвратно. Несмотря на моих могущественным покровителей дело стоит. А ждать неохота.

 

Расскажите про себя.

 

Саша.

[Nestor]

  Desert rabbit сказал:

Расскажите про себя.

См. личку

[Nestor]

Смотрю, уже в 1997 году были зарегистрированы патенты. Вы сразу начали с мат моделирования? Или первые пептиды были получены эмпирически?

[Desert rabbit]

  Nestor сказал:

Смотрю, уже в 1997 году были зарегистрированы патенты. Вы сразу начали с мат моделирования? Или первые пептиды были получены эмпирически?

 

Не-ее эмпирикой такую рыбку не словишь. Тыщу лет сеть забрасывать... Водичка уж больно мутная. Тока матикой ее, родимую. Механизма же мы до сих пор не поняли. Да и зачем? Для этого академические институты есть. А наше дело жилу в тайге найти. Геологи мы. Как Дженнер :)

 

А когда меня про механизмы начинают допрашивать я крутую отмазку нашел - тоже спрашиваю так ехидненько - Вы вот о механизмах действия беспокоитесь, а не изволите над просветить, каков механизм действия аспирина? И больше вопросов про механизму мне не задают. Потому как до сих пор споры идут о том как аспирин действует. А я не то что бы ну совсем уж не знаю, но раньше времени не хочу это обсуждать.

[Nestor]

Понял